A história se passa dois anos e meio após a partida de Uzumaki Naruto para um treinamento com Jiraiya para fora de Konohagakure no Sato. Após seu retorno, Uzumaki Naruto e sua equipe, agora em nova formação, engajam em uma investigação da Akatsuki, e de um possível resgate de Uchiha Sasuke, agora sob comando de Orochimaru. O principal empecilho de Uzumaki Naruto, e Konohagakure no Sato, em Naruto: Shippuuden é a organização Akatsuki, já que Uchiha Sasuke se juntou a ela, e essa está causando muitos problemas. Começou a ser exibida no dia 15 de fevereiro de 2007 na TV Tokyo, e no dia 2 de fevereiro de 2009 nos Estados Unidos pelo site oficial via streaming. No segundo semestre de 2009 foi adquirido pela Disney para passar no seu canal a cabo Disney XD.

Nº de Episódios: 103 ao 128
Duração em Média: 20 Min.
Tamanho em Médio: 50 Mb
Formato: Rmvb
Áudio: Japonês
Legenda: Português – BR
Nome dos Episódios: Clique AQUI

Episódio 105 - A batalha pela barreira
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Episódio 106 - Camélia Vermelha
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Episódio 107 - Companheiros inexperados
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Episódio 108 - O caminho da Camélia
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Episódio 109 - O Contra-Ataque do Selo Amaldiçoado
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Episódio 110 - A memória de culpa
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Episódio 111 - Promessa quebrada
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Episódio 112 - Um lugar para se retornar
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Episódio 113 - Culpa
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Episódio 114 - Olho do Falcão
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Episódio 115 - A espada de Zabuza
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Episódio 116 - Vigia da Prisão de Ferro
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Episódio 117 - Juugo do esconderijo do norte
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Episódio 118 - Formação
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Episódio 119-120 - A vida de um garoto no campo de batalha (Kakashi Gaiden)
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Episódio 121 - Aqueles que se movem
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Episódio 122 - A caçada
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Episódio 123 - Conflito
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Episódio 124 - Arte
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Episódio 125 - Desaparecimento
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Episódio 126 - Crepúsculo
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Episódio 127 - Contos de um Ninja Corajoso - Pergaminho Ninja do Jiraya - Parte 1
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Episódio 128 - Contos de um Ninja Corajoso - Pergaminho Ninja do Jiraya - Parte 2
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